学术进展
我们的森林分子育种团队在miRNA形成和遗传调控领域取得了新的进展 [发布日期:2018-07-06点击次数: ]

TR

MicroRNA(miRNA)是长度约为20-25个核苷酸的小RNA,其在生长,发育和抗逆性的调节中起关键作用。揭示miRNA的形成,等位基因变异模式和遗传调控机制,并回答一系列科学问题,如“miRNA来自何处?他们在哪里工作?“是森林遗传改良和分子育种的基础,为提高木材产量,提高木材质量具有重要意义。然而,在人类遗传学或植物学研究中,只有参与miRNA加工过程的个体成员进行了遗传变异测试,并且分配了miRNA生物途径中所有基因的等位基因,以及由此产生的miRNA表达模式如何变化,进而影响它们与靶基因的遗传相互作用,尚未系统地进行。

为此,张德强教授的团队依靠国家重点研究发展计划(No. 2016YFD0600102)和国家自然科学基金(No. 31670333)系统地实施miRNA生物发生基因(miRBGs)和下游靶基因等位基因。首次。该基因座的功能调控和相互作用机制(miRBGs-miRNA-target基因),研究结果最近在线发表在生物TOP期刊《

New Phytologist》(IF:7.433,生物学领域),引起了国际同行的广泛关注。

利用模式树种毛白杨(Populus tomentosa)作为材料,利用RNA-seq技术和生物信息学方法,鉴定出80个miRBG,152个miRNA和457个在二级血管组织中差异表达的靶基因。检测到11,400(miRBG),5,860(MIRNA)和20,916(靶基因)SNP位点。研究表明,每个miRBG SNP的等位基因变异导致大多数miRNA的表达水平发生显着变化。

结合群体遗传学和相关遗传学策略,确定了324个SNP位点,这些位点与树木生长和木材品质性状显着相关,每个位点占表型变异的1.46%至14.09%。与木质素显着相关的miRBG,MIRNA和靶基因的不同基因型表达模式显示miRBG中的SNP可以改变miRBG-miRNA和miRNA-靶基因的表达,表明miRBG突变可以影响miRNA表达丰度。此外,下游靶基因表达的调控是表型性状遗传变异的基本决定因素,构建了影响森林生长和木材质量变异的miRBG-miRNA-目标上位性相互作用网络,即森林生长和木材。品质特质。分子育种提供理论指导和技术支持。

这篇文章的第一作者是博士。澳门皇冠学生陈伟,张德强教授为通讯作者,团队成员陈金辉,杜庆章,周大玲等参与了该研究的具体实验工作。

附件论文标题: microRNA生物发生基因的遗传变异作为杨树二次生长的新指标。

链接到论文:https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/nph.15262。

澳门皇冠,高精度中心)